| Clasificación ind. Etapa Segunda |
| 1 º | 21 | RODRÍGUEZ, Joaquín | ESP | KAT | 3:26:22 | |
| 2 º | 25 | MORENO, Daniel | ESP | KAT | +03 | |
| 3 º | 1 | SÁNCHEZ, Samuel | ESP | EUS | +07 | |
| 4 º | 86 | SIMON, Julien | FRA | SAU | +09 | |
| 5 º | 44 | COBO, Juan José | ESP | GEO | +10 | |
| 6 º | 141 | GARCÍA, Ricardo | ESP | ORB | +10 | |
| 7 º | 17 | LASTRAS, Pablo | ESP | MOV | +10 | |
| 8 º | 45 | FELLINE, Fabio | ITA | GEO | +13 | |
| 9 º | 114 | GERARD, Arnaud | FRA | FDJ | +13 | |
| 10 º | 102 | SERRY, Pieter | BEL | TOP | +13 | |
| 11 º | 14 | LÓPEZ, David | ESP | MOV | +13 | |
| 12 º | 82 | JEANDESBOZ, Fabrice | FRA | SAU | +13 | |
| 13 º | 15 | PARDILLA, Sergio | ESP | MOV | +13 | |
| 14 º | 7 | ANTON, Igor | ESP | EUS | +13 | |
| 15 º | 2 | NIEVE, Mikel | ESP | EUS | +13 | |
| 16 º | 43 | BLANCO, David | ESP | GEO | +13 | |
| 17 º | 87 | TALABARDON, Yannick | FRA | SAU | +13 | |
| 18 º | 18 | VENTOSO, Francisco | ESP | MOV | +13 | |
| 19 º | 116 | ELISSONNNE, Kenny | FRA | FDJ | +20 | |
| 20 º | 41 | MENCHOV, Denis | RUS | GEO | +22 | |
| 21 º | 115 | LADAGNOUS, Matthieu | FRA | FDJ | +22 | |
| 22 º | 91 | GARZELLI, Stefano | ITA | ACQ | +29 | |
| 23 º | 63 | ATAPUMA, Darwin | COL | COL | +33 | |
| 24 º | 11 | ARROYO, David | ESP | MOV | +35 | |
| 25 º | 51 | BENÍTEZ, José Alberto | ESP | AND | +35 | |
| 26 º | 28 | VORGANOV, Eduard | RUS | KAT | +35 | |
| 27 º | 81 | BESSY, Cyril | FRA | SAU | +39 | |
| 28 º | 65 | OSPINA, Dalivier | COL | COL | +46 | |
| 29 º | 53 | PIEDRA, Antonio | ESP | AND | +46 | |
| 30 º | 132 | MAS, Luis | ESP | BUR | +46 | |
| 31 º | 3 | OROZ, Juan José | ESP | EUS | +54 | |
| 32 º | 68 | PAEZ, Héctor Leonardo | COL | COL | +59 | |
| 33 º | 94 | DONATI, Alessandro | ITA | ACQ | +01:03 | |
| 34 º | 101 | ARMEE, Sander | BEL | TOP | +01:05 | |
| 35 º | 142 | CABEDO, Victor | ESP | ORB | +01:07 | |
| 36 º | 22 | KARPETS, Vladimir | RUS | KAT | +01:09 | |
| 37 º | 98 | SARMIENTO, Cayetano José | COL | ACQ | +01:09 | |
| 38 º | 112 | GUESDON, Frédéric | FRA | FDJ | +01:09 | |
| 39 º | 57 | ROSENDO, Jesús | ESP | AND | +01:17 | |
| 40 º | 106 | CORNU, Dominique | BEL | TOP | +01:17 | |
| 41 º | 107 | COENEN, Johan | BEL | TOP | +01:17 | |
| 42 º | 103 | STEURS, Geeat | BEL | TOP | +01:17 | |
| 43 º | 76 | SANTORO, Antonio | ITA | AND | +01:17 | |
| 44 º | 121 | DOI, Yukihiro | JPN | SKI | +01:22 | |
| 45 º | 26 | HORRACH, Juan | ESP | KAT | +01:22 | |
| 46 º | 38 | RYABKIN, Alexander | RUS | CAJ | +01:22 | |
| 47 º | 13 | INTXAUSTI, Beñat | ESP | MOV | +01:22 | |
| 48 º | 62 | CANO, Alex | COL | COL | +01:22 | |
| 49 º | 24 | LOSADA, Alberto | ESP | KAT | +01:22 | |
| 50 º | 67 | SUÁREZ, Camilo Andrés | COL | COL | +01:22 | |
| 51 º | 42 | DE LA FUENTE, David | ESP | GEO | +01:30 | |
| 52 º | 105 | BAUGNIES, Jerome | BEL | TOP | +01:30 | |
| 53 º | 78 | DOMENE, Ramon | ESP | AND | +01:35 | |
| 54 º | 35 | MORA, Arturo | ESP | CAJ | +01:35 | |
| 55 º | 125 | GENIEZ, Alexandre | FRA | SKI | +01:44 | |
| 56 º | 148 | SAEZ DE ARREGI, Adrián | ESP | ORB | +01:44 | |
| 57 º | 31 | CUESTA, Iñigo | ESP | CAJ | +01:44 | |
| 58 º | 136 | JENNINGS, Christopher | RSA | BUR | +01:58 | |
| 59 º | 77 | SOLARI, Luca | ITA | AND | +02:05 | |
| 60 º | 48 | VALLS, Rafael | ESP | GEO | +02:07 | |
| 61 º | 83 | MARINO, Jean Marc | FRA | SAU | +02:07 | |
| 62 º | 58 | RAMÍREZ, Javier | ESP | AND | +02:07 | |
| 63 º | 96 | MIHOLJEVIC, Vladimir | CRO | ACQ | +02:07 | |
| 64 º | 92 | CODOL, Massimo | ITA | ACQ | +02:07 | |
| 65 º | 72 | BARLA, Luca | ITA | AND | +02:07 | |
| 66 º | 54 | ROLDAN, José Luis | ESP | AND | +02:07 | |
| 67 º | 133 | ANTON, Manuel | ESP | BUR | +02:07 | |
| 68 º | 93 | DI PAOLO, Francesco | ITA | ACQ | +02:07 | |
| 69 º | 131 | BELDA, David | ESP | BUR | +02:07 | |
| 70 º | 46 | ARDILA, Mauricio | COL | GEO | +02:07 | |
| 71 º | 128 | LUDVIGSSON, Tobias | SWE | SKI | +02:07 | |
| 72 º | 124 | HUGUET, Yann | FRA | SKI | +02:07 | |
| 73 º | 64 | LAVERDE, Luis Felipe | COL | COL | +02:07 | |
| 74 º | 85 | POUX, Paul | FRA | SAU | +02:07 | |
| 75 º | 95 | CORIONI, Claudio | ITA | ACQ | +02:07 | |
| 76 º | 6 | LANDA, Mikel | ESP | EUS | +02:15 | |
| 77 º | 75 | RODRÍGUEZ, Jackson | VEN | AND | +02:22 | |
| 78 º | 34 | MORENO, Javier | ESP | CAJ | +02:23 | |
| 79 º | 16 | HERRADA, Jesús | ESP | MOV | +02:26 | |
| 80 º | 126 | REIMER, Martin | GER | SKI | +02:30 | |
| 81 º | 117 | ROLLIN, Dominique | CAN | FDJ | +02:30 | |
| 82 º | 71 | VICIOSO, Angel | ESP | AND | +02:38 | |
| 83 º | 47 | RATTO, Daniele | ITA | GEO | +02:40 | |
| 84 º | 36 | GARCÍA, Egoitz | ESP | CAJ | +02:41 | |
| 85 º | 32 | HERRADA, José | ESP | CAJ | +02:41 | |
| 86 º | 33 | SIMON, Jordi | ESP | CAJ | +02:41 | |
| 87 º | 8 | ASTARLOZA, Mikel | ESP | EUS | +02:43 | |
| 88 º | 4 | ISASI, Iñaki | ESP | EUS | +02:43 | |
| 89 º | 97 | NAPOLITANO, Danilo | ITA | ACQ | +02:53 | |
| 90 º | 122 | BONNIN, Thomas | FRA | SKI | +03:03 | |
| 91 º | 135 | ORENGO, Pascual | ESP | BUR | +03:12 | |
| 92 º | 147 | URAIN, Beñat | ESP | ORB | +03:36 | |
| 93 º | 113 | OFFREDO, Yoann | FRA | FDJ | +03:36 | |
| 94 º | 12 | G. ACOSTA, José Vicente | ESP | MOV | +04:49 | |
| 95 º | 143 | ZABALO, Xabier | ESP | ORB | +04:49 | |
| 96 º | 37 | ROMERO, Igor | ESP | CAJ | +04:49 | |
| 97 º | 138 | JIMÉNEZ, Rubén | ESP | BUR | +04:49 | |
| 98 º | 104 | SALOMEIN, Jarl | BEL | TOP | +04:49 | |
| 99 º | 127 | CHAIGNEAU, Robin | NED | SKI | +04:49 | |
| 100º | 111 | HUTAROVICH, Yauheni | BLR | FDJ | +04:49 | |
| 101º | 23 | KUSCHYNSKI, Aliaksandr | BLR | KAT | +04:49 | |
| 102º | 144 | ETXEBARRIA, Aritz | ESP | ORB | +04:49 | |
| 103º | 52 | CABELLO, Antonio | ESP | AND | +04:49 | |
| 104º | 66 | FORERO, Juan Pablo | COL | COL | +04:49 | |
| 105º | 61 | PEÑA, Victor Hugo | COL | COL | +04:49 | |
| 106º | 74 | ERMETI, Giairo | ITA | AND | +04:49 | |
| 107º | 108 | DE KETELE, Kenny | BEL | TOP | +04:49 | |
| 108º | 73 | BERTOLINI, Alessandro | ITA | AND | +04:49 | |
| 109º | 56 | PALOMARES, Adrián | ESP | AND | +05:04 | |
| 110º | 55 | LOBATO, Juan J | ESP | AND | +05:05 | |
| 111º | 123 | OOSTLANDER, Sander | NED | SKI | +06:58 | |
| 112º | 88 | TORTELIER, Etienne | FRA | SAU | +06:58 | |
| 113º | 145 | MARTIN, Noel | ESP | ORB | +07:02 | |
| 114º | 5 | BILBAO, Peio | ESP | EUS | +07:02 | |
| 115º | 27 | SILIN, Egor | RUS | KAT | +07:02 | |
| 116º | 137 | VERONA, Carlos | ESP | BUR | +07:02 | |
| 117º | 146 | BIZKARRA, Mikel | ESP | ORB | +07:02 | |
| 118º | 84 | MARTIAS, Rony | FRA | SAU | +09:38 | |